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町村制の施行により、南大隅郡辺田村・川南村・山本村・川北村・横別府村の区域をもって小根占村（こねじめむら）が発足。 1896年（明治29年）3月29日 - 所属郡が肝属郡に変更。 1941年（昭和16年）1月1日 - 小根占村が町制施行して根占町となる。 1950年（昭和25年）4月1日 - 一部の地域を田代町に編入。