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補給本部（ほきゅうほんぶ）は、日本の海上自衛隊又は航空自衛隊に設置される機関の一つ。各自衛隊における需品、機材等の調達・管理等の総合調整及び補給処の管理を行う。また、陸上自衛隊には同様な役割をもつ機関として陸上自衛隊補給統制本部がある。 海上自衛隊の補給本部は海上自衛隊補給本部を参照。 航空自衛隊の補給本部は航空自衛隊補給本部を参照。