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若くして天才と呼ばれ、1924年に日本棋院が設立されるとすぐに参加している。そこで中国から来た呉清源と出会い、後に彼は友人でありかつ最大の好敵手となる。この頃、海山太郎が経営する大相撲の二所ノ関部屋に居候して日本棋院へ通っていた。 木谷と呉は1933年から1936年ごろに「新布石」と呼ばれる革新的な序盤理論を発表している。