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2005年（平成17年）10月1日の市町村合併の際に制定された。横手市の「よ」と「Y」、旧平鹿郡の「ひ」をモチーフにデザインされている。市章は3色で構成されており、シンボルカラーである「横手美の里色（よこてみのりいろ）」「横手萌木色（よこてもえぎいろ）」「横手花浅葱色（よこてはなあさぎいろ）」がそれぞれ使用されている。