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事などを歴任。明治5年（1872年）、岡山県権参事に就任。参事を経て、1875年7月19日、権令に昇進。地租改正に当り地主・豪農層の意見を取り入れて減租計画を立て大蔵省と交渉するが、国の二度の拒否により岡山県下の地租改正反対闘争が盛んとなり、石部は病気を理由に辞職願を出し、同年10月7日に依願免官となった。晩年は家居して学問を教授した。