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口腔生化学（こうくうせいかがく、英語：biochemistry and molecular dentistry）とは、基礎歯学の一分野で、主に生化学的・分子生物学的手法を用いて口腔内疾患および組織を研究する分野である。他の名称として、口腔分子生物学（こうくうぶんしせいぶつがく）、口腔医化学（こうくういかがく）などの呼び名がある。