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開頭手術は腫瘍や血栓、弾丸といった異物の除去、外傷性脳損傷（TBI）などの脳病変に苦しむ患者に行われる重要な手術であることが多い。 パーキンソン病、癲癇（てんかん）、小脳振戦の治療のために脳深部刺激装置などの機器を外科的に留置することもできる。癲癇の手術では、その原因となっている脳の部位を切除するためにこの術式が使用される。