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Pax遺伝子（ぱっくすいでんし）とは一群の転写活性因子であり、特に動物の発生期に重要な働きを持つことがわかっている。ペアードドメインと呼ばれるDNA結合ドメイン構造を持つことからその名が付けられたが、分子によってはその他のドメインも有する。 哺乳動物は9のメンバーからなり、構造により４つのサブファミリーに分類される。