A生態系せいたいけい保全ほぜんでは、そこに生息せいそくする生物せいぶつのことを考慮こうりょするが、生態系せいたいけいを構成こうせいするすべての生物せいぶつを等ひとしく扱あつかうことはできない。なぜなら、一部いちぶの生物せいぶつを守まもろうとすると、必かならず不利益ふりえきを被こうむる生物せいぶつが生しょうじるからである。すなわち、われわれ人間にんげんが何なにをしても、それによって利益りえきを得える生物せいぶつと不利益ふりえきを受うけるものが生しょうじることになる。そうなると、生態系せいたいけいを保全ほぜんする目的もくてきで、何なんらかの活動かつどうをするということは、一部いちぶの生物種せいぶつしゅに利益りえきを与あたえるということになる。(中略ちゅうりゃく)唯一ゆいいつわれわれが言いえることは、われわれが人類じんるいであるから、「地球ちきゅう生態系せいたいけいは人類じんるいが健全けんぜんに生いきていくためにある」ということである。すなわち、「生態系せいたいけいは人類じんるいのため」なのである。言いい換かえれば、人類じんるいに利益りえきを与あたえてくれる生態系せいたいけいを保全ほぜんすべきなのである。(花里はなざと孝幸たかゆき『自然しぜんはそんなにヤワじやない一誤解いちごかいだらけの生態系せいたいけい』による)B保全ほぜん生物学せいぶつがくの核かくとなる概念がいねんである生物多様性せいぶつたようせいは種しゅの存続そんぞくによって維持いじされる。したがって、保全ほぜん生物学せいぶつがくでは、希少種きしょうしゅや減少げんしょう過程かていにある個体群こたいぐんの保全ほぜんに関かんする知識ちしきと方法ほうほうが一ひとつの重要じゅうような課題かだいである。(中略ちゅうりゃく)しかし、個別こべつの種しゅをそれぞれ保護ほごすることは非常ひじょうに困難こんなんである。一ひとつの生態系せいたいけいをとっても、微生物びせいぶつから植物しょくぶつ、昆虫こんちゅう、哺乳動物ほにゅうどうぶつなど多おおくの種しゅが生存せいぞんしているが、それらの全すべての生態せいたいを把握はあくして保護ほごすることは不可能ふかのうに近ちかい。さらに、未分類みぶんるいの種しゅや種しゅ{レベル}以下いかの遺伝的多様性いでんてきたようせいは、個別こべつの種しゅを保護ほごする方法ほうほうでは逆ぎゃくに保護ほごされなくなってしまう恐おそれがある。そこで、多様たような生物せいぶつの相互関係そうごかんけいを含ふくむ自然しぜんをそのまま保全ほぜんすることが重要じゅうようになってくる。つまり、生態系せいたいけいを保全ほぜんすることで、そこに含ふくまれる全すべての生物せいぶつを保護ほごするという考かんがえている。
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